MatsuLab. Lecture Note/sougouenshu2007/round3/mpich2

MPICH2 †

• Cellist には MPICH2-1.0.6p がすでに入っています
• which mpirun とかやって、無いとか言われたらおしえて

MPICH2 コンパイルの仕方 †

• 基本的にはgcc の使えるオプションはすべて使えます
• mpi.c をコンパイルする方法

  mpicc mpi.c -o mpi

• 他にもライブラリが必要な場合はつける（以下はN体ライブラリと算術ライブラリの追加)

  mpicc mpi.c -o mpi -lm -lnbody -L/path/to/libnbody -I/path/to/libnbody

  • -l はリンクライブラリの指定
  • -L はライブラリの存在するディレクトリの追加（math ライブラリは標準ライブラリのため、gccに登録済み、省略できる)
  • -I はヘッダファイル(*.h) の存在するディレクトリの追加（math.h は標準ライブラリのため、gccに登録済み、省略できる)

MPICH2 実行方法 †

• 使いたいノードのホスト名を書いたファイルをつくる

  echo cellist0 > machinefile
  echo cellist1 >> machinefile
  echo cellist2 >> machinefile
  echo cellist3 >> machinefile

  • machinefile の中は以下のようになる

    cellist0
    cellist1
    cellist2
    cellist3

  • もし使いたくないノードがあればはずす
• MPIプロセスを複数ノード実行するための mpd というアプリケーションを実行する
  • machienfile にかかれたノードの上から 3台を使いたいときは

    mpdboot -n 3 -f machinefile

  • ちゃんと起動したか確認、mpdの起動したノードのホスト名が見れる

    mpdtrace

• MPI プログラムを実行する
  • 4プロセスでカレントディレクトリの mpi というプログラムを実行させたいときは

    mpirun -np 4 ./mpi もしくは mpiexec -n 4 ./mpi

• MPICH の使用を終了する
  • 起動した mpd をすべて終了する

    mpdallexit